在适宜生态区域，对征集和收集的种质资源进行繁殖和基本生物学特征特性鉴定评价，经过整理、整合并结合农民认知进行编目，入库（圃）妥善保存种质资源8.2万份。2021年，重点对前几年收集的3.8万份种质资源进行评估、入库（圃）保存。
（二）畜禽普查重点任务
1.畜禽遗传资源基本情况普查
以县域为单位，对全国所有行政村的现有畜禽（包括蜂和蚕，下同）地方品种、培育品种、引入品种进行全面普查，查清群体数量、区域分布、保护利用等情况。以省级行政区划为单位，开展品种特征特性、生产性能等指标测定和描述，采集品种影像。2021年，以青藏高原及新疆部分地区为重点发掘鉴定一批新资源。
2.畜禽遗传资源系统调查与遗传材料采集制作
开展畜禽遗传资源性能测定、特征特性等专业系统调查、重点区域现场核查。根据畜禽地方品种种群数量、区域分布等，科学评估珍贵稀有程度和濒危等级。抢救性采集制作畜禽遗传材料。2021年，采集制作畜禽遗传材料5万份。
3.畜禽遗传资源评估和入库保存
以省（自治区、直辖市）为单位，对辖区内新发现的畜禽遗传资源，组织技术专家组进行初步判定评估后，提交国家畜禽遗传资源委员会依法依规进行鉴定。对珍贵稀有濒危资源保护实行“一品一策”，明确保护主体、保护措施，采取活体保护和遗传材料保存相结合，实施抢救性收集保护。2021年，公告一批新发现的畜禽遗传资源，入库保存一批畜禽遗传材料。
（三）水产种质资源普查重点任务
1.水产养殖种质资源基本情况普查
以县域为单位，对全国所有养殖场（户）（含水产原良种场、遗传育种中心、苗种场和普通养殖场等）的原种、培育种（地方品系和新品种）、引进种进行基本情况调查，查清群体数量、区域分布和保护利用等情况，采集品种影像，核实调查数据、资源情况，汇总普查信息。
2.水产养殖种质资源系统调查与收集
在基本情况普查基础上，依托具有鉴定评价基础和优势的承担单位，开展水产养殖种质资源情况系统调查，根据种群数量、区域分布等，科学评估特征特性和遗传多样性，采集制作遗传材料。
3.水产养殖种质资源评估和入库保存
组织技术专家组对水产养殖种质资源进行重要特征特性、遗传多样性评估，根据基本情况普查和系统调查结果，活体资源纳入保种场保护、相应遗传材料纳入种质库妥善保存。
在完成上述普查收集工作基础上，开展种质资源普查结果分析评价。一是开展农业种质资源登记。根据评估结果，对入库（场、区、圃）保存的农作物、畜禽、水产种质资源进行统一登记，实现种质资源身份信息可查询可追溯。对农作物珍稀地方品种和具有开发利用前景的特色种质资源进行田间展示，促进共享利用。二是编写资源状况报告。编写第三次全国农作物种质资源普查报告、国家畜禽遗传资源状况报告、水产养殖种质资源状况报告。发布年度十大农作物优异种质资源、国家畜禽遗传资源品种名录、国家水产养殖种质资源种类名录。修订畜禽和蜂遗传资源志书，编写蚕遗传资源志书。三是建设大数据平台。建立健全农业种质资源数据库，构建全国统一的农业种质资源大数据平台，普查基本情况、种质资源登记、种质资源动态变化、保存保管等信息统一纳入平台，推进数字化动态监测、信息化监督管理。
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